吳茱萸“味辛溫。主溫中，下氣，止痛，咳逆寒熱，除濕血痹，逐風邪，開腠理。根，殺三蟲。”

吳茱萸味辛、苦，氣溫，主入足厥陰肝經、足太陰脾經，辛溫能暖脾胃，苦能降逆止嘔、咳，即“溫中、下氣”，故可治療脾胃虛寒、運化失常之嘔吐、泄瀉、腹痛，也可治療胞宮虛寒之月經病；而且，吳茱萸的“止痛”作用很強，凡脾胃虛寒或肝胃虛寒導致的痛癥，如胃痛、脅痛、厥陰頭痛、婦女痛經、寒疝等，表現為喜溫喜按，惡心嘔吐，納呆腹脹，畏寒肢涼，便溏泄瀉，舌淡苔白，脈沉弦或遲者，尤宜于用吳茱萸，如吳茱萸湯、導氣湯、溫經湯、四神丸等。

慢性腎衰竭之屬脾腎陽虛、水濕濁邪內盛，癥見尿少，水腫，嘔吐，泄瀉，納呆，腹脹者，可予以吳茱萸湯與真武湯合方溫腎健脾、利水降濁，藥用吳茱萸6克，黨參15克，生姜10克，大棗5枚，熟附片10克，茯苓30克，焦白術10克，益母草30克，車前子15克，其中，加益母草、車前子是為了加強利水作用。

慢性腹瀉久治不愈者，乃因脾陽虛弱，日久傷及腎，致命門火衰，強調溫腎固澀二法，用吳茱萸15克溫中散寒入脾，五味子100克收斂固澀入腎，此方雖簡，卻有良效。

左金丸乃黃連為君，佐少量吳茱萸為臣，用量為6:1，治療肝火犯胃證之脅痛口苦、嘔吐吞酸。余受此啟發，認為吳茱萸為君，佐少量黃連為臣，用量仍為6:1，可治療心腹積冷、心下結氣之胃寒證，凡見脘腹冷痛、脹氣，嘔吐吞酸，冷食不消，畏寒喜暖，舌淡苔潤，脈沉弦緊者，予以吳茱萸9克，黃連1.5克，山梔子3克。因腹內久郁寒濕，必蘊濕火，梔子入六經，泄三焦火，又能行結氣，故宜加之。

女性月經不調，少腹冷痛脹滯，經水色紫成塊，淋漓不盡者，為沖任虛寒、瘀血阻絡，經水不能循經而行，妄行于經絡之外而淋漓不盡，擬溫經湯去生姜加炮姜、烏賊骨化瘀止血，藥用當歸6克，白芍6克，吳茱萸6克，川芎6克，炮姜6克，法半夏6克，丹皮6克，麥冬10克，黨參10克，桂枝6克，阿膠6克,炙甘草6克，烏賊骨15克。婦女經行腹冷痛，嘔吐，經水紫黯有塊者，余常用少腹逐瘀湯加吳茱萸、生姜溫經散寒，止痛止嘔，療效顯著。

陰疽如流注、痰核、瘰疬、乳巖、橫痃、脫疽、貼骨疽、鶴膝風等，屬營血本虛、寒凝痰滯痹阻肌肉筋骨血脈關節所致者，癥見患處漫腫無頭，酸痛無熱，皮色不變，破潰膿液如血水不稠，口不渴，舌淡脈沉細等，可以吳茱萸300克，蓽茇100克，細辛100克研末，用醋調敷于局部，紗布固定，每日更換，同時內服陽和湯。

吳茱萸依靠其辛溫走散之性，通過開發腠理，達到逐風寒濕邪而止痹痛之功。

吳茱萸辛溫燥烈，容易耗氣動火，故陰虛有熱者忌用。吳茱萸有小毒，臨床不宜用量過大、服用時間過長。